学院选择是玩家进入魔法世界的第一步。游戏还原了原著中霍格沃茨四大学院的设定，分别是格兰芬多、赫奇帕奇、拉文克劳和斯莱特林。这四大学院各有特色，但选择时需明确一点：学院差异主要体现在院徽、长袍装饰和宿舍风格等视觉元素上，对游戏核心玩法如主线剧情、魔法课程和决斗竞技等几乎不产生影响。唯一的功能性区别在于社交系统，玩家只能与同学院且同性别的角色成为室友。
从象征意义来看，四大学院对应不同元素与特质。格兰芬多以狮子为标志，象征火元素，代表勇气与冒险精神；赫奇帕奇獾院象征土元素，体现正直与忠诚品质；拉文克劳鹰院代表风元素，以睿智与博学为特征；斯莱特林蛇院则象征水元素，强调野心与审时度势的能力。这种设定源自原著世界观，但游戏中并未将元素特性转化为实际战斗属性或技能加成，选择时不必过度考虑战力因素。
实际选择过程中，建议优先考虑个人审美偏好。格兰芬多宿舍以猩红色调为主，配有燃烧的壁炉；拉文克劳休息室充满学术气息；赫奇帕奇环境温馨质朴；斯莱特林则呈现幽暗神秘的绿色基调。服装方面，院徽会永久显示在长袍上，不同学院的配色方案各有特点。若希望与特定好友同住，必须确保选择相同学院和性别设定，这是游戏中唯一不可更改的社交限制。
部分玩家可能希望通过分院测试确定选择。游戏内置的测试题目没有标准答案，系统会根据答题倾向推荐学院，但该结果仅具参考价值，最终决定权仍在玩家手中。学院选择后无法更改，因此建议在分院仪式场景中仔细查看各学院介绍再确认。对于追求特定游戏体验的玩家，斯莱特林的爆发型战斗风格或赫奇帕奇的草药学倾向可作为次要参考因素。
